Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'11-Segment pdb3eoh1A.i131-143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3eoh:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | REFINED GROUP II INTRON STRUCTURE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | GROUP IIC INTRON | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.12 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (131, 143) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGGAACACGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C2'-endo, 6: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 10: C2'-endo, 13: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 4: syn, 5: syn, 9: syn, 11: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |