Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '4-Hairpin pdb3dj01A.e149-154 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 3dj0:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTALLIZATION OF THE THERMOTOGA MARITIMA LYSINE RIBOSWITCH BOUND TO L-4-OXALYSINE | ||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA (174-MER) | ||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||
| Position | (149, 154) | ||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUCU_ | ||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C2'-endo, 5: C1'-exo | ||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||