Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'16-Hairpin pdb3dis1A.e38-55 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3dis:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTALLIZATION OF THE THERMOTOGA MARITIMA LYSINE RIBOSWITCH IN FREE FORM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (174-MER) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.10 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (38, 55) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AUCAGGGGAGGAAUCG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C1'-exo, 3: C2'-endo, 4: O4'-endo, 5: C1'-exo, 6: C2'-endo, 10: C2'-exo, 15: C1'-exo, 16: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |