Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '4-Hairpin pdb3dio1X.e149-154 | |||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 3dio:X (&rarr PDB) | ||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTALLIZATION OF THE THERMOTOGA MARITIMA LYSINE RIBOSWITCH BOUND TO LYSINE, IRIDIUM HEXAMINE SOAK | ||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA (174-MER) | ||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.40 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||
| Position | (149, 154) | ||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUCU_ | ||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C2'-endo, 5: C1'-exo | ||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||