Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'8-Segment pdb3df31A.i1171-1180 | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 3df3:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIAL RIBOSOME FROM ESCHERICHIA COLI IN COMPLEX WITH HYGROMYCIN B. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT OF THE SECOND 70S RIBOSOME, WITH HYGROMYCIN B BOUND. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1171, 1180) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGGAAGGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
7: C2'-endo, 8: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |