Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-3-Internal Loop pdb3df1FA.n1400-1493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 3df1:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIAL RIBOSOME FROM ESCHERICHIA COLI IN COMPLEX WITH HYGROMYCIN B. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT OF THE FIRST 70S RIBOSOME, WITH HYGROMYCIN B BOUND. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1401, 1492), (1405, 1487) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AAGU_-_UCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C4'-exo, 6: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |