Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-4-Internal Loop pdb3d5cFA.n143-158 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 3d5c:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURAL BASIS FOR TRANSLATION TERMINATION ON THE 70S RIBOSOME. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, RELEASE FACTOR 1 (RF1), TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES OF THE SECOND 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
16S RRNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.21 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (138, 164), (143, 158) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CUAAU_-_ACAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 6: C2'-exo, 12: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||