Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-3-Internal Loop pdb3d5cFA.n1382-1470 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3d5c:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURAL BASIS FOR TRANSLATION TERMINATION ON THE 70S RIBOSOME. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, RELEASE FACTOR 1 (RF1), TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES OF THE SECOND 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.21 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1383, 1469), (1387, 1464) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AAGU_-_UCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-exo, 5: C3'-exo, 6: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |