Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb3d5aFA.n134-168 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3d5a:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURAL BASIS FOR TRANSLATION TERMINATION ON THE 70S RIBOSOME. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, RELEASE FACTOR 1 (RF1), TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.21 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (138, 164), (143, 158) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CUAAU_-_ACAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 6: C2'-exo, 12: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |