Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'12-Hairpin pdb3d5a1A.e311-324 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3d5a:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURAL BASIS FOR TRANSLATION TERMINATION ON THE 70S RIBOSOME. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, RELEASE FACTOR 1 (RF1), TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.21 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (311, 324) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _ACUGAGACACGG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
8: C2'-endo, 9: C1'-exo, 10: C1'-exo, 11: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn, 9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |