Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-8-Internal Loop pdb3cf51X.n612-750 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 3cf5:X (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | THIOPEPTIDE ANTIBIOTIC THIOSTREPTON BOUND TO THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF DEINOCOCCUS RADIODURANS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RRNA-23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (613, 749), (619, 740) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CGAAA_-_AGAUAGCU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 5: C4'-exo, 10: C4'-exo, 13: C4'-exo, 14: O4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |