Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-6-Internal Loop pdb3cf51X.n1955-2046 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 3cf5:X (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THIOPEPTIDE ANTIBIOTIC THIOSTREPTON BOUND TO THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT OF DEINOCOCCUS RADIODURANS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | RRNA-23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1959, 2042), (1965, 2035) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AGUCU_-_UGGCGG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
7: C2'-exo, 14: O4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||