Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-Hairpin pdb3bt71C.e5-15 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3bt7:C (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF E. COLI 5-METHYLURIDINE METHYLTRANSFERASE TRMA IN COMPLEX WITH 19 NUCLEOTIDE T-ARM ANALOGUE | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (5'-D(P*GP*CP*UP*GP*UP*GP*(5MU) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.43 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (5, 15) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUUCGAUCC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 3: C4'-exo, 7: C2'-exo, 8: O4'-exo, 9: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |