Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'13-Segment pdb3bo31B.i131-145 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 3bo3:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | A RELAXED ACTIVE SITE FOLLOWING EXON LIGATION BY A GROUP I INTRON | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | GROUP I INTRON P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.40 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (131, 145) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUAGAGACUAGAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C3'-exo, 5: C1'-exo, 6: C2'-exo, 9: C4'-exo, 11: C4'-exo, 12: C2'-endo, 13: C2'-endo, 14: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |