Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '11-Segment pdb2vqf1A.i692-704 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2vqf:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.9 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (692, 704) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAACGCCGAUG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C3'-exo, 9: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||