Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb2vqeFA.n134-168 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2vqe:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 2.5 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (138, 164), (143, 158) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CUAAU_-_ACAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |