Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-7-Internal Loop pdb2vqeFA.n1096-1133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2vqe:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 2.5 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1102, 1127), (1110, 1120) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGCACU_-_UUGCCAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C2'-endo, 16: C3'-exo, 17: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |