Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-4-Internal Loop pdb2vhp1A.n1440-1454 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2vhp:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 4 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1434, 1459), (1440, 1454) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUAGC_-_GCGC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 5: C2'-exo, 6: C2'-exo, 11: O4'-exo, 12: C4'-exo, 13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||