Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '15-Segment pdb2vhp1A.i1389-1405 | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2vhp:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 4 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1389, 1405) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _ACACACCGCCCGUCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C2'-endo, 3: C2'-exo, 4: C2'-endo, 5: C3'-exo, 6: C2'-exo, 7: C3'-exo, 8: C4'-endo, 11: C2'-exo, 15: C2'-exo, 17: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||