Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-7-Internal Loop pdb2vhoFA.n1423-1469 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2vho:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 3 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1424, 1468), (1432, 1461) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CCACUU_-_AAAGAAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: O4'-exo, 2: C2'-exo, 5: C4'-exo, 6: C2'-exo, 8: C2'-exo, 9: C4'-exo, 13: O4'-exo, 14: C2'-exo, 15: C2'-exo, 16: C2'-exo, 17: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
13: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |