Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '12-Segment pdb2vho1A.i399-412 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2vho:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 3 OF 4) | ||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||
| Position | (399, 412) | ||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUGUAUGAAGAA_ | ||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-exo, 9: C3'-exo, 10: C1'-exo, 11: O4'-endo, 12: C4'-exo, 14: C2'-exo | ||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn, 13: syn | ||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||