Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-Hairpin pdb2vho1A.e1085-1092 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2vho:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 3 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1085, 1092) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UUAAGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 4: C2'-exo, 5: C2'-exo, 6: C2'-endo, 7: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn, 6: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||