Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-7-Internal Loop pdb2vhn1B.n843-919 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2vhn:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME. (PART 2 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (844, 918), (851, 910) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AUUCAU_-_AAUGUUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 8: C2'-exo, 11: C2'-exo, 14: C4'-endo, 15: C3'-exo, 16: C1'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
14: syn, 15: syn, 16: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||