Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-5-Internal Loop pdb2vhn1B.n286-354 | |||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2vhn:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME. (PART 2 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
Position | (291, 349), (295, 343) | ||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUA_-_AAAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 4: C4'-exo, 6: C2'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-endo, 9: C2'-exo, 10: C1'-endo, 12: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |