Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '19-Segment pdb2vhn1B.i1560-1580 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2vhn:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME. (PART 2 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1560, 1580) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CUAAGCAUCAGGUAACAUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-exo, 9: C2'-exo, 11: C2'-exo, 15: C2'-exo, 16: C2'-exo, 17: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||