Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-4-Internal Loop pdb2vhmFB.n2467-2492 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2vhm:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 1 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2469, 2490), (2474, 2483) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UCCCAA_-_GGGG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C3'-exo, 3: C2'-exo, 4: C2'-exo, 5: C4'-exo, 11: C1'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |