Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-6-Internal Loop pdb2vhmFA.n18-63 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2vhm:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 1 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
5S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (20, 61), (27, 55) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AAACG_-_UGGUCC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-exo, 3: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-endo, 8: C2'-exo, 9: C2'-exo, 10: C1'-endo, 11: C1'-endo, 12: C3'-exo, 15: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
11: syn, 12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||