Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-5-Internal Loop pdb2vhm1B.n2027-2572 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2vhm:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 1 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2029, 2570), (2036, 2564) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCGGCA_-_GCCGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 3: C2'-exo, 4: C2'-exo, 5: C2'-exo, 7: C3'-exo, 8: C2'-exo, 9: C2'-exo, 12: C4'-exo, 13: C2'-exo, 15: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |