Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-4-Internal Loop pdb2vhm1B.n1307-1315 | |||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2vhm:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 1 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1300, 1320), (1307, 1315) | ||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUCCAA_-_GGGC_ | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 5: C1'-exo, 6: C2'-exo, 10: C3'-exo, 11: C2'-exo, 12: C2'-exo, 14: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |