Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-5-Internal Loop pdb2vhm1A.n18-63 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2vhm:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 1 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (20, 61), (27, 55) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGGUCC_-_AAACG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 4: C3'-exo, 5: C1'-endo, 6: C1'-endo, 7: C2'-exo, 8: C2'-exo, 9: C2'-endo, 10: C2'-exo, 13: C2'-exo, 14: C2'-exo, 15: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn, 5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |