Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'14-Segment pdb2vhm1A.i96-111 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2vhm:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF PDF BINDING HELIX IN COMPLEX WITH THE RIBOSOME (PART 1 OF 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.74 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (96, 111) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAGAGUAGGGAACU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C2'-exo, 11: O4'-endo, 12: C3'-exo, 16: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |