Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-5-Internal Loop pdb2uxdFA.n352-361 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2uxd:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA CGGG IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.2 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (346, 365), (352, 361) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UGA_-_CAAUG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 11: O4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||