Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '8-Hairpin pdb2uxd1A.e1396-1405 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2uxd:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA CGGG IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.2 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1396, 1405) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GGGAGCCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C4'-exo, 4: C3'-exo, 7: O4'-exo, 8: C2'-exo, 9: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 5: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||