Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '8-Hairpin pdb2rn11B.e4-13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2rn1:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | LIQUID CRYSTAL SOLUTION STRUCTURE OF THE KISSING COMPLEX FORMED BY THE APICAL LOOP OF THE HIV TAR RNA AND A HIGH AFFINITY RNA APTAMER OPTIMIZED BY SELEX | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA (5'- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (4, 13) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUCCCAGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-endo, 2: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||