Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-Hairpin pdb2rn11A.e5-12 | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2rn1:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | LIQUID CRYSTAL SOLUTION STRUCTURE OF THE KISSING COMPLEX FORMED BY THE APICAL LOOP OF THE HIV TAR RNA AND A HIGH AFFINITY RNA APTAMER OPTIMIZED BY SELEX | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA (5'- | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (5, 12) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CUGGGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
7: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||