Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'19-Segment pdb2rkj1G.i169-189 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2rkj:G (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | COCRYSTAL STRUCTURE OF A TYROSYL-TRNA SYNTHETASE SPLICING FACTOR WITH A GROUP I INTRON RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (238-MER) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 4.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (169, 189) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGUGAUAUAGUCUGAACAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C2'-exo, 7: C4'-exo, 8: C4'-exo, 10: C2'-exo, 15: C2'-exo, 19: C2'-exo, 20: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
15: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |