Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-5-Internal Loop pdb2qouFA.n1237-1292 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2qou:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIAL RIBOSOME FROM ESCHERICHIA COLI IN COMPLEX WITH SPECTINOMYCIN. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT OF THE FIRST 70S RIBOSOME, WITH SPECTINOMYCIN BOUND. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.93 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1243, 1286), (1249, 1280) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AUAAA_-_ACAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C4'-endo, 6: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |