Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-3-Internal Loop pdb2qnh1y.n757-783 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2qnh:y (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | INTERACTIONS AND DYNAMICS OF THE SHINE-DALGARNO HELIX IN THE 70S RIBOSOME. THIS FILE, 2QNH, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1VSP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.83 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (758, 782), (762, 778) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AAA_-_GUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 6: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||