Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-1-Internal Loop pdb2qnh1y.n1415-1437 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2qnh:y (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | INTERACTIONS AND DYNAMICS OF THE SHINE-DALGARNO HELIX IN THE 70S RIBOSOME. THIS FILE, 2QNH, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1VSP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.83 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1418, 1434), (1423, 1432) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGGA_-_A_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |