Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '12-Segment pdb2qnh1y.i534-547 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2qnh:y (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | INTERACTIONS AND DYNAMICS OF THE SHINE-DALGARNO HELIX IN THE 70S RIBOSOME. THIS FILE, 2QNH, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, TWO TRNA, AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1VSP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.83 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (534, 547) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CGGAUUCACUGG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-exo, 5: C3'-exo, 8: C4'-exo, 10: C2'-exo, 11: C4'-exo, 12: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||