Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'17-Segment pdb2qex10.i2180-2198 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2qex:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | NEGAMYCIN BINDS TO THE WALL OF THE NASCENT CHAIN EXIT TUNNEL OF THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.90 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2180, 2198) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCCCUAUGGCUAUCUCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 6: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 15: C4'-exo, 16: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |