Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'1-5-Internal Loop pdb2otjF0.n1696-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2otj:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | 13-DEOXYTEDANOLIDE BOUND TO THE LARGE SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 2.90 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1699, 2009), (1705, 2007) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _G_-_AGCAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |