Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-6-Internal Loop pdb2ogo10.n2404-2462 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2ogo:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH THE PLEUROMUTILIN DERIVATIVE RETAPAMULIN (SB-275833) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.66 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (2401, 2469), (2404, 2462) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UC_-_ACGCGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C4'-exo, 10: C4'-exo, 12: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||