Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '13-Segment pdb2ogo10.i2272-2286 | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2ogo:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH THE PLEUROMUTILIN DERIVATIVE RETAPAMULIN (SB-275833) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.66 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (2272, 2286) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GGGCUUAGUGAAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 11: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||