Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-6-Internal Loop pdb2ognF0.n2733-2759 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2ogn:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH THE PLEUROMUTILIN DERIVATIVE SB-280080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.56 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2735, 2757), (2742, 2751) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUUCA_-_GCACGC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C4'-exo, 11: C2'-exo, 14: C4'-exo, 15: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |