Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-5-Internal Loop pdb2ogn10.n2742-2751 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2ogn:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH THE PLEUROMUTILIN DERIVATIVE SB-280080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.56 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2735, 2757), (2742, 2751) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCACGC_-_GUUCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C4'-exo, 5: C2'-exo, 12: C4'-exo, 13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |