Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-7-Internal Loop pdb2ogm10.n1717-1753 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2ogm:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS COMPLEXED WITH THE PLEUROMUTILIN DERIVATIVE SB-571519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1723, 1747), (1729, 1739) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GCCAA_-_GACGUAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C4'-exo, 4: C4'-exo, 9: C2'-exo, 10: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||