Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-6-Internal Loop pdb2o43FA.n212-239 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2o43:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF 23S RRNA OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS IN COMPLEX WITH THE MACROLIDE ERYTHROMYCYLAMINE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
23S RRNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.60 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (215, 236), (222, 230) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAACC_-_UUAGUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
8: C2'-exo, 11: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||