Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-7-Internal Loop pdb2o431A.n1729-1739 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2o43:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF 23S RRNA OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS IN COMPLEX WITH THE MACROLIDE ERYTHROMYCYLAMINE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.60 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1723, 1747), (1729, 1739) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCCAA_-_GACGUAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 10: C4'-exo, 12: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 13: syn, 14: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |