Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'27-Segment pdb2o431A.i561-589 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2o43:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF 23S RRNA OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM DEINOCOCCUS RADIODURANS IN COMPLEX WITH THE MACROLIDE ERYTHROMYCYLAMINE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.60 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (561, 589) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-exo, 22: C2'-exo, 26: C2'-exo, 28: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
22: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |